Taruto egy emberformájú kiscica, aki nemrég költözött egy új városba a gazdáival. Ahogy járja a várost, egyre több új barátot szerez, miközben meggyőződése, hogy varázserővel bír, mert szerinte ő a régen kihalt Nekomata klán utolsó leszármazottja.

Hikaru Shindo rátalál a nagypapája szobájában egy véres go táblára, melynek belsejében egy ősi go mester, Fujiwara-no-Sai van bezárva, aki évszázadokkal ezelőtt még a japán uralkodónak tanította ezt a játékot. Ezután Fujiwara Hikaru elméjének részévé válik. Együtt félelmetes go csapatot alkotnak, Fujiwara a végső lépést akarja elsajátítani, amíg Hikaru azon fáradozik, hogy riválisát, Touya Akirát legyőzze.

A középiskolás Asau Daisuke tehetséges festő, de éppen alkotói válságban van. A gyermekkori barátnője, Tachibana Amane meggyőzi, hogy fesse meg a diáktársuk, Kimikage Yurina portréját, aki hamarosan életmentő szívműtéten fog átesni. A portré festése közben Daisuke ráeszmél, milyen fontos számára Amane.

Nem sokkal azután, hogy Tokióba költözött, a 12 éves Suzuhara Misaki megismeri az Angelic Layert, egy népszerű harci játékot, amiben a játékosok az angyaloknak nevezett mechanikus bábukon keresztül küzdenek meg egymással. Újonc létére Misaki ígéretes tehetségnek bizonyul, új barátokra talál és egyre több Angelic Layer mérkőzésen vesz részt, remélve, hogy egyszer ő lehet az országos bajnok.

A történet főszereplői ARMS implantátumokkal ellátott fiatalok, akik elképesztő dolgokra képesek a végtagjaikkal, és ezt egy titkos szervezet a saját javára akarja felhasználni.