Hashimoto Shun meleg regényíró, aki egy nap találkozik a csendes, középiskolás diákkal Chibana Mioval Okinawán. Mio árva, akinek el kell hagyni a szigetet a tanulmányai miatt, ám az együtt töltött kevés idő elég ahhoz, hogy meghatározza a további életüket.

Tokió városát a "Jelenségek" fenyegetik, melyeknek a megfékezésére csakis a Trinary csapat képes. Olyan lányokról szól az anime és a játék története, akik mind különleges képességekkel rendelkeznek, és hatalmas harcosokká válva, behatolva a "Jelenségek"be küzdenek meg a "Klán" tagjaival. A lányok szemtől szembe küzdenek meg egymással és ellenségeik elméjével.

Amakusa Ryou, a jóképű és sikeres üzletember, aki nem mellesleg nagy nőcsábász hírében áll, első látásra beleszeret a középiskolás húga legjobb barátnőjébe, Arima Ichikába. Ezt követően elhalmozza az otaku lányt a szerelmével, amit Ichika leginkább undorodva él meg, ez azonban nem tántorítja el Ryout attól, hogy tovább ostromolja választottját.

A Taisho-korban néhány ember megfertőződött egy vírussal, melynek köszönhetően a vámpírok erejével bírnak. A kormány őket akarja felhasználni arra, hogy szuperkatonákat hozzon létre.

Az anime egy háromtagú család életét mutatja be. Az egészet a 11 éves Naho (az idősebb lánytestvér) szemszögéből láthatjuk. Miután anyjuk meghalt, Naho vette át a helyét, így azóta ő vigyáz kistestvérére, a néhány éves Jun-ra. Apjuk sokat dolgozik, ritkán van otthon, így a kislány élete kortársaival ellentétben az öccsére való vigyázásban és a ház körüli teendők ellátásban merül ki.