A sztori egy átlagos tanítási napon kezdődik, pontosítva egy énekórán, ahol a fiúk együtt gyakorolják a kórusfesztiválra tervezett darabot, egyedül egy diák tátog csupán, amire szőke loboncos Kusakabe Hikaru fel is figyel. Később, tanítás után a bentójáért visszatérve a terembe ott találja a korábban kiszúrt fiút, Sajou Rihito–t. A zenészbandában játszó Kusakabe felajánlja a mintadiák Sajounak, hogy ezentúl készüljenek együtt a dallal.

Egy alternatív világban, ahol a szellemek és az emberek együtt léteznek, nem mindenki léphet be Requiem utcába. Csak azok az emberek, akik gondviselő szellemmel rendelkeznek. Xia Ling csak egy normális egyetemi gyakornok volt, de egy véletlen találkozó megváltoztatja a hétköznapi életét... A gonosz lelkekkel teli világban együttműködhet a felügyelőjével a túlélés érdekében?

A Japán-tenger négy kisebb szigetén járunk, amelynek technológiája igencsak megelőzi a jelenkori Japánét. Az antigravitációs részecskék, majd az antigravitációs lábbelik felfedezésével az emberek számára egy teljesen új világ nyílt meg, amiben szabadon repkedhetnek a felhők között, minden egyéb repülőeszköz használata nélkül. Kis idő múlva már saját sportágat is kapott a találmány, a Repülő Cirkuszt. 

A főszereplő, akit Faternak, azaz "Ossan"-nak is hívnak, egy jóképű, csinos, de egyben fegyelmezetlen férfi, elvált apuka, aki vécéülőke tervezőként dolgozik. A kislányával, Min-channal él együtt, aki mind a tudományok területén, mind a sportokban is jeleskedik. Egy nap, miközben Ossan a vécén ül, az beszívja őt és hőssé alakul át, akinek meg kell védenie a világot.

A címben szereplő "Nazo-toki" olyan történetekre utal, amiknek a középpontjában fejtörők vannak, mint például a Professor Layton játéksorozat.