Az akció orientált fantasy történet főszereplői a japán irodalom nagy alakjai, mint például Edogawa Ranpo, Miyazawa Kenji és Dazai Osamu, vagy a kortárs japán irodalomból Ayatsuji Yukito (Another) és Kyogoku Natsuhiko (Mouryou no Hako), míg a nyugati irodalomból olyanok képviseltetik magukat mint Fjodor Dosztojevszkij, Agatha Christie és Dan Brown. Ezek az írók mindannyian természetfeletti erőkkel rendelkeznek és a Fegyveres Nyomozó Ügynökség tagjaiként különböző rejtélyeket kell megoldaniuk.

A történet Sakamoto, korunk legmenőbb középiskolásának mindennapi életét követi nyomon. Amikor hősünk megkezdi tanulmányait új iskolájában, rövid időn belül nemcsak az osztálya, hanem a teljes diákság figyelmét sikerül felkeltenie. Féltékeny diáktársai mindent megtesznek, hogy megalázó helyzetekbe hozzák Sakamotót, a próbálkozásaik azonban rendre visszafelé sülnek el, és csak még vagányabbá teszik vele a srácot.

Chihiro világ életében bele lett nevelve a házimunkába, ám anyukája fiatal korában eltávozott. Ez után a nagybácsija vette magához a fényűző villába. Ugyan Chihiro nem akarja elfogadni ezt az ajánlatot, de amint meglátja, hogy milyen rendetlenség van ott, rögtön takarítani kezd. Nagybácsija ezt kihasználva egy ajánlatot tesz neki: az ott maradásáért ő lesz a takarító.

Endra a neve annak a titokzatos világnak, amely a Föld felszíne alatt található. Egy nap, a felszínen csak egy átlagos középiskolásnak számító Asanaga Shun egy rejtélyes kristályra bukkan az édesapja vállalatánál, amit megérintve hirtelen Endra világában találja magát. Egész pontosan Emirio, a börtönben sínylődő koronaherceg cellájában köt ki, aki bosszút akar állni Endra jelenlegi uralkodóján, Deruzain királyon és visszaszerezni a trónját. A két fiú kénytelen összefogni céljaik elérésében.