A Tokió külvárosában található Hachimitsu Magánakadémiát az ország legkülönb leányiskolájaként tartották számon, egészen mostanáig. A változó idők azonban új szemléletet várnak az intézménytől, ezért az igazgató úgy határoz, hogy ezentúl a fiú tanulók is felvételt nyerhetnek az iskolába.

A Hacka Doll eredetileg egy mobil alkalmazás, amely a megfelelő szűrők beállítása után olyan híreket gyűjt össze a felhasználó számára, amik az ő érdeklődési körébe tartoznak - úgy mint anime, BL, cosplay, járékok, light novel, manga, seiyuuk, stb. Az anime önálló személyiségekkel ruházza fel az app három Hacka Doll változatát.

Ichinose Futaba egy egyszerű lány, akinek az az álma, hogy seiyuu legyen. Ezért jelentkezik egy meghallgatásra az Aozora stúdiónál. De nincs egyedül. Ugyanis egy Moesaki Ichigo nevű másik lány is jelentkezik, aki jelenleg egy gyárban dolgozik. Valamint Kohana Rin is, aki még iskolába jár. Ők hárman természetesen összebarátkoznak és megkezdődik számukra a seiyuuk igazi élete, ahol nem csak animeszereplők hangjává kell válni, hanem énekelni és rádióműsort is kell vezetni.

A történet színhelye a távoli Gift bolygó, amelynek felszíne alatt nagy mennyiségben található az értékes Giftjium ásvány. Itt, az Indigó Kert nevű bányászvárosban él Amagi Sogo, akinek a hobbija a ritka és különleges kristályok gyűjtése. Egy nap, mikor hősünk belekeveredik az iskolatársai által okozott rendbontásba és eltéved a barlangrendszerben, a régi bányászromok alatt egy földalatti tóra bukkan, ahol összeismerkedik Feliával, egy rejtélyes, kék hajú és vörös szemű lánnyal.