Az ifjú Cardia egy rejtélyes betegségtől szenved: a bőre olyan halálos mérgeket tartalmaz, amik mindent elkorhasztanak vagy megolvasztanak, bármihez is érjen hozzá a lány. Egy napon, mikor a Királyi Őrség azzal a szándékkal tör be a házába, hogy foglyul ejtsék hősnőnket, a lány váratlanul egy pártfogóra is szert tesz a mestertolvaj Arsène Lupin személyében. Segítségével a lánynak sikerül elmenekülnie a katonáktól, majd ezt követően a páros útnak indul, hogy megkeressék Cardia eltűnt édesapját és választ kapjanak tőle a lány rejtélyes betegségének eredetére.

A film története a szerelem és a csodák körül forog, főszereplői pedig két középiskolás diák, Mitsuha és Taki. Mitsuha családja egy hegyvidéki kis faluban él és a helyi szentélyt vezetik, a lány azonban nagyvárosi életre vágyik. Taki pedig Tokió központjába jár iskolába és az építész pálya iránt érdeklődik. Egyik éjjel mindketten azt álmodják, hogy a másik életét élik, és annak ellenére, hogy soha nem találkoztak, keresni kezdik egymást.

Az osztályba egy új fiú került, aki már korábban megtapasztalta a poklot. Az iskolaváltás azonban nem oldotta meg a problémát, mert ismét kap egy rejtélyes parancsot, amit teljesítenie kell. Amennyiben 24 órán belül nem hajtja végre a kiszabott feladatot, meghal. Eleinte próbálja elmondani új osztálytársainak, hogy ez valódi, és súlyos következményekkel járhat a megtagadás, de addig nem hisznek neki, míg nincs meg az első áldozat.

A történet helyszíne a Sakaneko Magánakadémia, ahol három barátnő, Asagaya Minoa, Kamiigusa Arisu és Kouenji Miko megalapítják az iskola anime klubját.

Az emberi civilizáció elpusztult, ám Chito és Yuuri túlélték a katasztrófát. Van egy kis lánctalpas motorkerékpárjuk, és azzal róják céltalanul a végtelen utakat. Minden napjuk az élelem, a hibás alkatrészek és az üzemanyag keresésével telik, de amíg együtt lehetnek, nem számít nekik semmilyen nehézség. Így vándorolnak napról napra a kihalt romok között, és az eltelt idő alatt a köztük kialakult érzések lassan értelmet adnak az életnek...