Visszacsöppenünk a középkori Európa hangulatához, ahol épp háború dúl. Katonák, zsoldosok, démonok harcolnak egymással, amikor becsöppen főszereplőnk, Guts.

A 3. és 4. Világháború után vagyunk. A technológia fejlett: szinte alig van olyan, akinek ne lenne valamilyen beültetése vagy mű testrésze. Szinte minden embernek van ún. kiberagya, amivel közvetlenül össze tud kapcsolódni számítógépekkel vagy másik emberrel.

Egy mangaka akaratán kívül képes egy kicsit visszutazni az időben, hogy megakadályozza a bűncselekményeket. Egyszer azonban egy nagyobb ügy kerül elé, ahol egészen iskolás koráig kell visszautaznia.

A Fajok Közti Kulturális Csereprogram törvény értelmében Japánba fél-emberek jöttek. Azonban csak akkor maradhatnak, hogyha mindig a befogadójukkal mennek valahova és nem csinálnak bajt. Persze, ez egyáltalán nem könnyű akkor, hogyha egy embernek kell figyelni egy csomó fél-emberre.

Takamachi Nanoha boldogan éli a napjait, míg meg nem hall egy különös hangot. Első alkalomkor egy menyétet talál, amin segít is, de már másodjára a hang forrásánál egy szörnyre bukkan.