A Cross Game Kou Kitamura és Aoba Tsukishima, a négy szomszédos Tsukishima nővér egyikének a története. Egy időugrás után a második rész Kou-val kezdődik, aki titokban edz. Amikor belép a Seishu High-ba, barátai - Akaishi és Nakanishi - miatt csatlakozik a baseball klubhoz. Az átmeneti igazgató felvett egy új vezetőedzőt, aki cserébe másik iskolákból vesz fel kiválóan baseballozó diákokat. A csapat sztárja Yuhei Azuma, aki az iskola kedvence lett.