A Maromi kutya világszerte ismert kabala lett, akit Tsukiko gyerekkori kiskutyájáról mintázott. A piac kereke azonban nem állt meg, most egy másik megbízást kapott, egy olyan kabalát kell alkotnia, amely híresebb lesz majd, mint Maromi most. A lány teljesen el van havazva a munkával, de semmi ötlete sincs. Egy este amikor hazafelé tart a munkájából, megtámadja valaki, a rendőröknek tett tanúvallomása alapján egy általános iskolás gyerek lehetett, akin aranyszínű görkorcsolya volt, a kezében pedig egy baseball ütő. Ezt a fiatal támadót nevezik el Shonen Batnak. Ahogy telik az idő, Shonen Bat rengeteg embert támad meg és juttat kórházba. A rendőrség nyomoz és próbálnak összefüggéseket keresni a támadások között - nem sok sikerrel. Egy biztos: akárkit is támadott meg Shonen Bat, az előtte vagy segítséget kért, vagy pedig azt kérte , hogy "legyen már vége valaminek".

Kaname Madoka egy teljesen átlagos lány. A középiskola második osztályába jár, vannak barátai, szerető családja, mégis kissé motiválatlan. Az élete teljesen felborul, amikor egy cserediák érkezik az osztályába. Különös módon sokat tud róla, és kissé ellenségesen viselkedik vele. A nap vége felé egy ismeretlen hang kéri a segítségét, amit csak ő hall. Nem lenne Mahou Shoujo anime, ha nem indulna a hang keresésére. Ez a lépés azonban események egész láncolatát indítja be, mely a sors és kétségbeesés végtelen labirintusába zárja szereplőinket.

A Summer Wars világában létezik egy óriási virtuális rendszer, mely olyannyira az emberiséget hivatott szolgálni, hogy rengetegen azon belül intézik el ügyeiket, vagy éppen ott végzik el mindennapi munkájukat. Történetünk főszereplője Kenji, aki tulajdonképpen egy "bukott monitorfejű matekolimpikon". Igen, matekból nagyon jó, de nem annyira, hogy országát képviselje az olimpiádon, és mellékállásában az OZ-t tartja karban, ennek köszönheti a monitorfej jelzőt. 

Iwase Mayuko édesapját kormányellenes lázadó gerillák elrabolták, és váltságdíjat követelnek, ám a korábbi tárgyalás a hadsereg bevonása miatt sikertelen volt, és a túsztárgyalót megölte a gerillák vezetője, Yusuf Ali Mesa. Yuugónak közvetlenül kell tárgyalnia a gerillákkal, mert nem akar az előző tárgyaló sorsára jutni, ráadásul a hadsereg számára fontosabb a lázadók kiirtása, mint a túsz élete, ezért ők nem szerezhetnek tudomást az ő céljáról.

Az emberiség hatalmas többsége abban a hitben él, hogy az egyetlen valóság az acél és beton világa, amelyet építettek. Mindazonáltal a bevezető narrátor hang arról biztosít minket, hogy az embereket alaposan félrevezették. Van egy másik valóság, ami párhuzamosan fut a saját síkunkkal, és ennek a bérlői olyan szörnyű teremtmények, akik méltán viselik a Démon nevet.