A főszereplő Daimon Kaito, aki szívdöglesztő külsejét meghazudtolóan egy zseni agyával van megáldva. Bármilyen rejtvény, fejtörő gyerekjáték számára. A puzzle-ökkel kapcsolatban országos versenyeket is rendeznek, valamint ugyanúgy, mint bármely versenyszerűen űzött játékban, itt is megvannak a puzzle mesterei. Azonban az Eistein becenevet birtokló Kaito egy nap furcsa feladvánnyal találja szemben magát. Egy Minotaur nevű alak egy halálos játékba hívja, ahol egy különleges nyeremény vár rá.

Kaname Madoka egy teljesen átlagos lány. A középiskola második osztályába jár, vannak barátai, szerető családja, mégis kissé motiválatlan. Az élete teljesen felborul, amikor egy cserediák érkezik az osztályába. Különös módon sokat tud róla, és kissé ellenségesen viselkedik vele. A nap vége felé egy ismeretlen hang kéri a segítségét, amit csak ő hall. Nem lenne Mahou Shoujo anime, ha nem indulna a hang keresésére. Ez a lépés azonban események egész láncolatát indítja be, mely a sors és kétségbeesés végtelen labirintusába zárja szereplőinket.

Főszereplőnk Aoi Kazuya, akinek a nővére meghalt a "Nova"-k elleni harcban. 4 évvel a nővére halála után Kazuya beiratkozik az Akadémiára, ahol első nap összetalálkozik a másodévesek legjobbjával, Satellizer L. Brigitte-tel, más néven az "Érinthetetlen Királynővel". Kazuya hirtelen a nővérét pillantja meg a lányban, és átöleli, ami miatt a lány elveszti a Karnevált. Amikor Kazuya meghallja, hogy Satellizer-senpai miatta vesztett, akkor bocsánatot akar kérni, ami még több gondot okoz neki, de Brigitte idővel egyre közelebb engedi a fiút, és egyre jobban összebarátkoznak.

Hasegawa Subaru a Nanashiba középiskola kosárlabda csapatának a tagja, ám a klubot egy évre feloszlatják, mert a klub elnöke beleszeretett egy 11 éves kislányba. Így Subaru kosárlabdázás nélkül tengeti a napjait, egészen addig, ameddig a nagynénje, Takamura Mihoshi meg nem kéri, hogy 3 napig vállalja el egy általános iskolai lány kosárlabda csapat edzését. Subaru nem nagyon akar beleegyezni, de a nagynénje nagyon meggyőző tud lenni, így a végén csak elvállalja.

A történet főszereplője a kicsit fiús, de igazán gyönyörű Chihaya Ayase, aki éppen új diákéveit kezdi meg a középiskolában. A topmodell nővérének árnyékában élő, kissé verekedős és tipikusan elvarázsolt lány egyetlen szenvedélye a Karuta nevű játék. Új iskolájában a bálványra vágyó fiúk nagy meglepetésére a vonzó külseje mellé egy fura, vérbeli “tomboy” természettel megáldott leányzót kapnak, aki így messze kiesik az iskolai idolok sztereotípiájából. Ráadásul a lány már első nap klubot akar alapítani, ahol Karuta játékot űzhet társaival, versenyekre járhat, barátokat szerezhet.