Gon Freeks átlagos napjait éli Whale Islanden (Bálna-sziget), mikor egy nap megjelenik Kaito, egy Hunter (különleges jogokkal bíró vadász, aminek rengeteg típusa van, mint például fejvadász, kutató, szakács, és kártyájuk segítségével rengeteg kiváltságban részesülnek), aki régi mesterét, Jint keresi, akiről évek óta nem tudnak semmit, viszont a leghíresebb Hunterek között tartják számon. Kiderül, hogy Jin Gon apja, és Kaito felajánlja neki, hogy váljon Hunterré, mikor 12 éves lesz. Gon 2 év elteltével elindul Hunterré válni nevelőanyja nagy bánatára. Ez persze nem olyan könnyű, mint gondolná, mivel le kell tennie egy több fordulós vizsgát, ahol több száz, esetleg ezer ember közül csak néhányan maradhatnak. Ebben segítségére lesz Leorio, Kurapica és Killua.