A középkori Japánban, az 1580-as évben az egész birodalomra kiterjedő háború dúl. Oda Nobunaga, a legendás hadvezér mindenkit eltipor, aki az útjába kerül. Az eszközök, amiket használ viszont nem teljesen tisztességesek, a hadseregében tankok, rakétaütegek, gépfegyverekkel felszerelt harcosok vannak, akik könnyűszerrel mészárolják le a védtelen embereket. A legfélelmetesebb "fegyvere" a halhatatlan, kiborgtestű Ginnai, aki vérbosszút esküdött a nindzsák ellen a családja kiirtása miatt. Az árnyékharcosok két szervezete, a Koga és az Iga nindzsák közös tervet eszelnek ki a szörnyeteg elpusztítására, ám a társa elvesztése miatt dühös Shishimaru kockázatos magánakcióba kezd.