A történetünk az I. világháború után játszódik Angliában. Hugh Anthony Disward (Huey) a nagyapja haláláról szóló és annak végrendeletét tartalmazó levél mellé kap egy rejtélyes kulcsot is. A levél szerint az a kulcs nyitja a 900.666 fantomkönyvet tartalmazó misztikus könyvtárat, Dantalian könyvtárát, amelynek örököse lett. Habár sejtése sincs, hogy ez mekkora felelősséggel jár, mivel olyan könyvekről van szó, melyeknek megíródniuk sem szabadott volna... A nagyapja kastélyában a pincében egy kislányra talál egy rakás könyv közt. A lány, Dalian eleinte nem valami kedves vele szemben. Azonban az első munkájuk során, egy fantomkönyv visszaszerzésekor kénytelen elfogadni Huey-t, mint az új Kulcsőrzőt és a könyvtár örökösét...