Vége az iskolának, kezdődik a nyár. Makimura Koutarou nagy dologra készül: a nyár folyamán be akarja vallani Serizawa Kahonak - az iskola egyik legszebb lányának -, hogy szerelmes belé. Nem meri megtenni személyesen, ehelyett szerelmeslevelet ír. Postásnak szomszédját és gyermekkori barátját, Ai-chant kéri fel. Ő elvállalja a feladatot, és aznap este úgy válnak el, hogy másnap Ai elviszi a levelet Kahonak. Ezután furcsa dolog történik: Koutaru észreveszi, hogy valaki követi: egy ballonkabátos lány, akinél egy homokóra van. A homokóra szerencsétlen módon összetörik, furcsa események sorát indítva el.

A távoli jövőben az emberiség megkezdte a világűr meghódítását, és már számos planétán létesített kolóniát. De háborúzni még mindig nem felejtettek el az emberek. A Jerra nevű bolygón a lakosok fellázadnak a földi irányítás ellen. A csatákban egyik fél sem tud a másik fölé kerekedni, csak egyre több szenvedést okoznak az ott élőknek. Ebben a korban a legfélelmetesebb harcosok a genetikailag módosított, emberfeletti M.D.S.-ek.

A 21. század végére a rejtélyes Cagaster-betegség a pusztulás szélére sodorta az emberiséget, óriás rovarokká változtatva a fertőzötteket. Kidou, a fiatal rovarvadász egy haldokló embert talál a sivatagban, aki megkéri, vigyázzon a lányára, Iliére, és kísérje őt haza az anyjához.

Meisuke Nueno egy kissé ügyefogyott, ugyanakkor lelkiismeretes tanár. Tűzbe tenné kezét a diákjaiéért. Látszólag szürke mindennapokat él, ám nem hétköznapi titkot rejteget: démonkarral rendelkezik. Kivételes erejével igyekeznie kell megvédeni saját magát és osztályát a rájuk leselkedő szörnyetegektől, és a kiszámíthatatlan veszélyektől.

Furinji Gokut leállították a fejesek, mikor egy kollégája gyilkossági ügyében nyomozott. Nem hallgatott rájuk, és titokban folytatta a nyomozást, melynek során elveszítette a bal szemét, és csak egy titokzatos bandának köszönhetően menekült meg. Kapott egy mesterséges szemet is, melynek segítségével közvetlen kapcsolata van a nettel, és képes bármilyen számítógépet irányítani.